自清雍正以来，乐家老店同仁堂被钦定为“御药供奉”，至乐家第八代已声名大震。病家著名纷繁求药，而日本浪人小野串连在乐家长大的曹化伦(雷镇语 饰)，蓄谋夺走密方药谱。 曹化伦盗方被老店东乐宏达(张铁林 饰)撞见，行凶放火，销毁乐家细料药库；又串连御药房白寺人拘留收禁御药银子，竟使老店落井下石，无钱制药，无药可售。王爷误以为乐家“拿搪”，一怒敕令撤消乐家御药供奉，另行招标。面临内外交困，乐宏达老待遇保住二百年老字号，毅然隔代传印，将堂印传给孙子乐宏达。 乐宏达临危受命，在妃耦徐瑞珍援助下，以海底捞月之功，夺回御药供奉。并获取光绪天子的赐匾。曹化伦又鼓舞王爷，敕令老店不得在官方售药，只供宫庭。乐宏达体味到“进则为良相，退则为良医”，“进而济世，退而济平易近”，“抗旨”卖药。乐宏达力助孙子，行使大总管李莲英的病情，一药回天。西太后毕竟开禁。 漂流北京被乐家收收留的女优丛玉珠，暗恋乐宏达，然而为救援乐宏达出狱，舍身将本人嫁给曹化伦。 甲午战争，清军赴朝鲜抗敌。乐宏达赶造出十万包“诸葛行军散”，赠予将士，却被药材估客借机抬价，欠下巨款。年关借主逼债，乐宏达借贷无门，愤而变卖祖宅。药材估客得知赠药启事，慨然摒弃债权。老店又一次尽处逢生。 丫头兰喷鼻之父胡七(冯恩鹤 饰)死里逃生，被诬追捕。乐家掩护胡七，却被曹化伦出卖。乐宏达将兰喷鼻收为义孙女。在徐瑞珍的撮合下，兰喷鼻与乐宏达喜结良缘。 八国联军炮轰大栅栏，老店店堂化于一炬。乐宏达命乐宏达、徐瑞珍陪同怀怀孕孕的兰喷鼻逃出京城，为乐家留下子女。小野率日本兵闯进乐家搜取密方，乐宏达〈应当是乐阔海(李保田 饰)〉以毒酒相酬，与之玉石俱焚。 乐宏达潜回京城，痛不欲生。他找到了爷爷收躲的秘方药谱，将其躲进乐宏达的棺材。曹化伦有疑，趁夜开棺，徐瑞珍和义伶响九霄计划将曹吓死。 老店在废墟上重张，乐宏达却因饱受摧残离他人世。垂死之际，正值他的儿子乐同仁满岁“抓周”。在满桌的官帽、元宝、笔墨、绸缎之间，小同仁却抓起了《同仁堂药典》……
