二十世纪初的日本太正时代，自明治维新以来的文化开化已举行了五十余年。 跟着西洋文化和日本当代文化的交汇融会，帝都·东京逐步成为当代化建筑鳞次栉比，蒸汽铁道、地下铁道纵横交织，马车、人力车、蒸汽车川流不息的富贵都会。然而，这也是一座有着怪物和咒术等非实际存在的魔幻都会。 为了匹敌从地底出现的壮大魔物“降魔”，陆军成立了由将校中的灵能者构成的特别部队——对降魔部队，成员即“二刀二剑”的4位继续者：米田一基，持有 “神刀·灭却”；山崎真之介，持有“光刀·无形”；藤枝菖蒲，持有“神剑·白羽鸟”；真宫寺一马，持有“灵剑·荒鹰”。四人仅凭本人的血肉之躯和手中的神剑与魔物作战，史称“降魔战争”。苦战的成果，堕进尽境的对降魔部队被迫使出最初的手段——行使“魔神器”策动“破邪之血”。魔神器克日本上古时代流传下来的三种祭器：剑、珠、玉，可以成为魔力的增幅器。继续真宫寺家“破邪之血”的一马，以本人的性命为代价用魔神器将降魔们封印，而山崎真之介也在此战中掉落…… 太正十一年，以妖僧天海为首的邪恶构造“黑之巢会”捋臂张拳。仇视近代文化的天海为了复辟德川幕府的统治，带领手下的死天王葵叉丹、弥勒、修罗、罗刹，操作着行使当代咒法生出的魔物——魔操机兵在帝都展开了破损活动。为了匹敌这新的威逼、守护帝都和平易近众，在花小路伯爵的大力撑持下，新的当局直属对降魔构造——帝国华击团（简称“帝击”）·花构成立了。在米田一基、藤枝菖蒲的领导下，花组集结了6名具有高灵力的少女：真宫寺一马的女儿、灵剑·荒鹰的继续者真宫寺樱；神崎财阀总帅忠义的孙女、精晓神崎风尘流长刀术的神崎堇；俄国反动的勇士、曾有“食火鸟”之称的玛丽亚·橘；自幼就因超凡的灵力被与世隔中断、年仅10岁的法国贵族令媛爱丽丝；在辛亥反动的战乱中掉亲人、精晓机械的中国少女李红兰；以及桐岛流白手的正统传人、身高近 2米的桐岛神奈。同时，基于山崎真之介留下的计划，由神崎重工实现了对降魔用灵子甲胄“光武”。以银座大帝国剧场为基地、常日以歌剧团脸孔出现来此地无银三百两的花组，在魔物出现时就会变为守护帝都的兵士，驾驶光武与仇敌作战。 太正十二年春，苦于战力及协作性不及的花组来了一位新队长——水兵少尉大神一郎，《樱花大战》的故事也就从这里开端了……
